63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1114 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 391 aa  799    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  40.33 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  38.56 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  38.63 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2624  phage major capsid protein, HK97 family  35 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0012  phage major capsid protein, HK97 family  31.54 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  28.99 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1645  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.4 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  23.82 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1459  phage major capsid protein, HK97 family  24.8 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  24.18 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  23.56 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  25.19 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  24.19 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  22.92 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  21.07 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2956  phage major capsid protein, HK97 family  25.61 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  22.22 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  26.87 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  24.02 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  22.01 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  22.67 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  25.48 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  22.01 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  23.28 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  22.99 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  23.97 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1584  HK97 family phage major capsid protein  23.25 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0506282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  22.8 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  23.55 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  21.71 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  23.11 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  23.9 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  21.94 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  23.19 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  21.77 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  23.1 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  21.24 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  22.82 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.38 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  21.62 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  22.92 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  22.43 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  22.02 
 
 		 387 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  23.75 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.67 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.74 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  24.59 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  21.91 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  24.59 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  21.2 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  23.17 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  22.74 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  23.44 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  22.56 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  21.13 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  20.96 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  22.39 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  23.36 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  22.14 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  22.16 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  23.39 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  21.73 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>