85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0672 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
506 aa  1027    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  36.9 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  35.94 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  30.98 
 
 
385 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  34.29 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2624  phage major capsid protein, HK97 family  28.94 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1645  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.31 
 
 
387 aa  110  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  32.18 
 
 
199 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  42.55 
 
 
197 aa  93.6  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  34.18 
 
 
203 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  37.59 
 
 
189 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  35.76 
 
 
177 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0012  phage major capsid protein, HK97 family  28.88 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  32.91 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  24.59 
 
 
514 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  38.58 
 
 
183 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  31.85 
 
 
190 aa  77  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  36.84 
 
 
220 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  36.84 
 
 
220 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  35.86 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  31.47 
 
 
172 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  34.44 
 
 
201 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  38.13 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  38.13 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5507  peptidase U35 phage prohead HK97  27.61 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.26 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  33.86 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  31.25 
 
 
169 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.98 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1459  phage major capsid protein, HK97 family  24.38 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2956  phage major capsid protein, HK97 family  25.84 
 
 
320 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  31.97 
 
 
186 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  26.86 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  26.29 
 
 
194 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  26.29 
 
 
194 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  26.29 
 
 
194 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  29.88 
 
 
194 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30 
 
 
190 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  29.75 
 
 
198 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  28.48 
 
 
222 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  28.48 
 
 
222 aa  57.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  23.43 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  26.19 
 
 
215 aa  57  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.98 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  27.37 
 
 
215 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  30.25 
 
 
221 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  30.25 
 
 
221 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.49 
 
 
196 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.49 
 
 
196 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  28.57 
 
 
220 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  28.66 
 
 
235 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1584  HK97 family phage major capsid protein  26.69 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0506282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  31.86 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  21.98 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  31.03 
 
 
183 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  24.88 
 
 
248 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  22.58 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  22.07 
 
 
403 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  28.76 
 
 
240 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  25 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.62 
 
 
382 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.16 
 
 
390 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.62 
 
 
382 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  29.71 
 
 
189 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  29.29 
 
 
384 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  22.92 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  29.17 
 
 
233 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  20 
 
 
397 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  29.81 
 
 
315 aa  47.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  25.95 
 
 
183 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  28.77 
 
 
177 aa  47  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  23.84 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  28.97 
 
 
177 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  23.53 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  27.27 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  20.29 
 
 
425 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  19.5 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  30.19 
 
 
176 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  30.65 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  26.11 
 
 
380 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  27.96 
 
 
441 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  19.74 
 
 
392 aa  43.9  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.89 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  20.99 
 
 
382 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  28.75 
 
 
213 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>