53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2995 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  100 
 
 		 369 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.93 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  25.92 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  27.27 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  28.03 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  27.53 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  22.83 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  27.12 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  27.56 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.44 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  26.02 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  24.2 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  23.21 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  24.68 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  24.34 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  24.49 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  25.99 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  25.22 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  24.93 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  25.22 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  21.76 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  21.76 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  22.91 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  22.72 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  24.25 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  27.12 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  25.28 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.38 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  24.8 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  25.15 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  30.05 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  25.74 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  27.43 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  27.43 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  23.27 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  23.33 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  24.6 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  24.77 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  24.33 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.06 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  25.95 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  24.77 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  23.79 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  24.12 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  28.09 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  23.39 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  23.11 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  24.3 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  23.08 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  20.24 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  24.53 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.75 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  24 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>