More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4580 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  90.83 
 
 
120 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  68.97 
 
 
144 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
118 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  78.16 
 
 
124 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  68.97 
 
 
118 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  68.97 
 
 
118 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  69.77 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
115 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  56.41 
 
 
115 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  56.41 
 
 
115 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  61.8 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  69.51 
 
 
124 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  62.92 
 
 
116 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
124 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
139 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
140 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  57.01 
 
 
125 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
124 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.64 
 
 
371 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  57.66 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
367 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  62.07 
 
 
125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  64.37 
 
 
124 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
360 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
360 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  51.82 
 
 
124 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  50.45 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  46.4 
 
 
137 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  55.91 
 
 
122 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  45.3 
 
 
127 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
179 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
324 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
163 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  58.89 
 
 
170 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
137 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  45.16 
 
 
131 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
221 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
121 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
358 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
137 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  44.8 
 
 
137 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
199 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  60.47 
 
 
114 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
122 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  53.92 
 
 
134 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  54.44 
 
 
257 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
165 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
213 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
150 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  45.97 
 
 
157 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  44.92 
 
 
129 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  50 
 
 
131 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  51.79 
 
 
122 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  61.63 
 
 
163 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.92 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  48.6 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.57 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
342 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.91 
 
 
211 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  55 
 
 
159 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
211 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
230 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
211 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  56 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  59.3 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
230 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  50.47 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
211 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
242 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.84 
 
 
242 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
303 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  47.75 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  49.07 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  49.04 
 
 
241 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
238 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
227 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
196 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.17 
 
 
239 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  46.49 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
198 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  54.55 
 
 
238 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
203 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
275 aa  94.4  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
275 aa  94.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
203 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
175 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
266 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
202 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
324 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.52 
 
 
267 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>