144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5363 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  49.1 
 
 		 839 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 853 aa  1726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  49.22 
 
 		 839 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  50.37 
 
 		 816 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  51.4 
 
 		 839 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  51.56 
 
 		 882 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  66.47 
 
 		 856 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  49.15 
 
 		 828 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  49.94 
 
 		 827 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  49.15 
 
 		 828 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  49.1 
 
 		 839 aa  750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  49.1 
 
 		 839 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  49.46 
 
 		 839 aa  756    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  49.22 
 
 		 839 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  49.1 
 
 		 839 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 		 816 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  49.7 
 
 		 825 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  49.15 
 
 		 828 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  50.68 
 
 		 812 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  51.24 
 
 		 882 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.39 
 
 		 826 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  47.39 
 
 		 820 aa  724    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.87 
 
 		 826 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  45.65 
 
 		 811 aa  618  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  36.77 
 
 		 821 aa  522  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  34.22 
 
 		 815 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  42.38 
 
 		 648 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.41 
 
 		 835 aa  195  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.44 
 
 		 837 aa  191  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.6 
 
 		 819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  27.88 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.64 
 
 		 864 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.26 
 
 		 842 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  26.69 
 
 		 847 aa  174  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  26.23 
 
 		 860 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  26.03 
 
 		 815 aa  173  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  28.89 
 
 		 833 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  25.98 
 
 		 823 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.24 
 
 		 845 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.61 
 
 		 845 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 786 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.51 
 
 		 813 aa  164  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 863 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  25.83 
 
 		 819 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 785 aa  161  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  27.71 
 
 		 824 aa  160  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.26 
 
 		 839 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  26.24 
 
 		 891 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  24.66 
 
 		 838 aa  158  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  24.9 
 
 		 819 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  27.53 
 
 		 861 aa  156  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 891 aa  157  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  26.02 
 
 		 824 aa  156  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  26.86 
 
 		 829 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 871 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  28.86 
 
 		 812 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  22.76 
 
 		 813 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 793 aa  147  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  28.27 
 
 		 831 aa  141  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  25.57 
 
 		 875 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 897 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.6 
 
 		 872 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.83 
 
 		 845 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  23.97 
 
 		 802 aa  132  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.57 
 
 		 817 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  26.62 
 
 		 880 aa  129  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  26.58 
 
 		 840 aa  125  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  26.49 
 
 		 846 aa  124  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.81 
 
 		 818 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  24.28 
 
 		 802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  26.85 
 
 		 799 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 663 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 843 aa  109  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.5 
 
 		 843 aa  106  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.79 
 
 		 962 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 724 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23 
 
 		 940 aa  92.8  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 739 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.84 
 
 		 720 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 763 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.26 
 
 		 744 aa  81.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.97 
 
 		 984 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 		 906 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 734 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.88 
 
 		 971 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.55 
 
 		 878 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.2 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  27.48 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.54 
 
 		 750 aa  62  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.06 
 
 		 609 aa  62  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.94 
 
 		 1243 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.54 
 
 		 602 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.66 
 
 		 743 aa  56.2  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.86 
 
 		 815 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.16 
 
 		 624 aa  55.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.87 
 
 		 1064 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.36 
 
 		 808 aa  54.7  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.85 
 
 		 864 aa  54.7  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 825 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 829 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>