More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1435 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 337 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  79.94 
 
 		 337 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  65.18 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  65.48 
 
 		 336 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  66.07 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  53.6 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  56.52 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  56.52 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  56.81 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  56.29 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  52.74 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  57.1 
 
 		 342 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  57.39 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  57.39 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  57.39 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  57.39 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  57.68 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  56.81 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.15 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.29 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.75 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.42 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.58 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.52 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.84 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.11 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  35.76 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  38.04 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.08 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  42.4 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  40.71 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.28 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  41.01 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  39.35 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  41.47 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  34.57 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.97 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  32.63 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  40.28 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  40.28 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.27 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  39.65 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.43 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  32.32 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.23 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  34.41 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  36.87 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  33.94 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  33.46 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  34.53 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  35.6 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.98 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.07 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.98 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  32.43 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  29.9 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 300 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.62 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  30.09 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  33.74 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  36.04 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.9 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.84 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  32.48 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.93 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  32.55 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  32.55 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  32.86 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  33.02 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.06 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  33.77 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  31.6 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  34.05 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.08 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.08 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  32.08 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  34.39 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3272  DNA polymerase III gamma/tau subunit  28.46 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.22 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.95 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.91 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.47 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.71 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>