163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3857 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  84.84 
 
 		 314 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  50.81 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  45.51 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  45.62 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  45.15 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  41.01 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  42.33 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  49.53 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  40.51 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  51.81 
 
 		 377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  50.6 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  60.8 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  34.59 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  55.47 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  44.53 
 
 		 428 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  45.1 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  43.57 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  43.33 
 
 		 388 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  38.99 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  42.48 
 
 		 428 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  34.36 
 
 		 388 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  45.04 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  41.91 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  34.81 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  44.14 
 
 		 429 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  36.77 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  37.71 
 
 		 521 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  46.15 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 		 445 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 		 549 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.59 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  48 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 		 694 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  40.82 
 
 		 653 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  37.72 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 		 509 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  38.03 
 
 		 538 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  42.24 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 372 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  35.76 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 689 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 		 562 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 433 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  34.24 
 
 		 231 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.98 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 653 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2659  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  34.16 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  43.81 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  41.82 
 
 		 667 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  36.42 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  41.09 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  45 
 
 		 655 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  39.57 
 
 		 511 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  40.68 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  26.62 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  27.48 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  42.34 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 523 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  38.85 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  40.85 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  39.49 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  39.82 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.94 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 556 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.16 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 		 492 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  38.66 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  35.86 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>