More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3845 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 564 aa  1155    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 		 560 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 546 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 534 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 		 544 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  31.63 
 
 		 546 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 546 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 546 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.35 
 
 		 520 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.75 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.75 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.75 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.32 
 
 		 535 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.95 
 
 		 560 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.57 
 
 		 521 aa  187  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 535 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.63 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.27 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 544 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 542 aa  180  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 541 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  29 
 
 		 553 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.23 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.67 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 		 534 aa  173  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.1 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.94 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 551 aa  170  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.47 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.66 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.95 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.99 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.26 
 
 		 540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 		 529 aa  163  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.65 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 522 aa  160  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 		 565 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.49 
 
 		 532 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  27.41 
 
 		 517 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.76 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.11 
 
 		 515 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  27.11 
 
 		 551 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 529 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 528 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.91 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 522 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.62 
 
 		 516 aa  153  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  29.32 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 495 aa  153  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.69 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.69 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.42 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.42 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>