More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0073 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  91.3 
 
 		 460 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  100 
 
 		 460 aa  904    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  73.89 
 
 		 464 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  68.64 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  68.19 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  69.27 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  69.04 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  62.56 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  62.17 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  63.66 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  39.91 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  39.69 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  39.69 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  39.69 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  39.69 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  39.69 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  39.69 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  39.41 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  39.5 
 
 		 462 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  40.05 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  39.82 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  38.78 
 
 		 462 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 470 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  37.3 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  37.9 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  38.27 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  38.27 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  38.27 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  37.3 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  36.17 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  33.48 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  33.48 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  36.18 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  34.31 
 
 		 467 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  32.14 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  35.41 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  32.89 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  36.73 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  36.49 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  32.25 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  35.71 
 
 		 470 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  36.65 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  32.65 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 450 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  29.45 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  36.43 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.72 
 
 		 477 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.72 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.44 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.18 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 467 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29.52 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  30.12 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  30.07 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  33.19 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.2 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  33.03 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2408  MATE efflux family protein  38.48 
 
 		 433 aa  179  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  30.61 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  30.32 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  32.16 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  35.36 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.28 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  29.88 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>