More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0086 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  74.07 
 
 		 229 aa  327  9e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  73.39 
 
 		 229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.97 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  47.09 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  47.09 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  48.83 
 
 		 249 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  48.78 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2413  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  50 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  48.64 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.27 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.27 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.62 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.16 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  47.89 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  47.89 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  47.89 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  45.78 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  47.89 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  47.03 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.61 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.58 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  47.89 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  48.25 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  49.07 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  48.29 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  44.64 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  47.49 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  48.64 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  46.08 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  49.06 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.09 
 
 		 240 aa  202  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  50.98 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  46.58 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  47.66 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  45.98 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 286 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  45.71 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  47.2 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  46.82 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  45.78 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.66 
 
 		 455 aa  201  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  47.8 
 
 		 260 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  48.02 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  42.04 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.3 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.35 
 
 		 293 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  47.8 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  46.12 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  41.82 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.73 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 291 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  47.64 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  47.42 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  44.69 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  50.25 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  42.92 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  46.19 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  46.95 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.39 
 
 		 288 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  44.75 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  47.27 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  45.58 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>