98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1960 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  94.01 
 
 		 167 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  93.41 
 
 		 167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  74.25 
 
 		 167 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  57.89 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  43.75 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  41.89 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  41.89 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  41.89 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  41.89 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  41.89 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  41.89 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  41.89 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  34 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  36.84 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  37.13 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  37.01 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  43.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  42.42 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  30.36 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  39.47 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  38.26 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  34.93 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  29.59 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  36.55 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  30.25 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  37.28 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  27.5 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  28.12 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  33.77 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30.57 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  31.48 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  32.54 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  36.94 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  32.54 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  36.94 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  36.94 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  36.94 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  33.12 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.65 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.65 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  28.74 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  34.39 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  30.25 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  28.14 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  31.29 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  27.61 
 
 		 333 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.68 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  27.56 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  29.92 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  27.89 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  31.84 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  32.16 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34 
 
 		 325 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.89 
 
 		 331 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.06 
 
 		 320 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  29.66 
 
 		 344 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  29.41 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  30.92 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.1 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  28.85 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  29.69 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  35.29 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  29.38 
 
 		 339 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  35.29 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  33.66 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  28.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  28.91 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  30 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  30 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  27.68 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  31.52 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  31.45 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  32.86 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>