More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1859 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  62.86 
 
 		 245 aa  328  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  62.04 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  57.14 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  55.69 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  41 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  40.33 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  41.1 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  39.34 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  36.6 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  34.85 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  34.44 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  35.27 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  34.45 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  38.8 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  39.33 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  34.03 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  34.03 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  34.03 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  34.03 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  34.03 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  37.92 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  34.71 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  38.21 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  38.21 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  37.97 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  36.32 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  36.76 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  36.71 
 
 		 270 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1217  tRNA pseudouridine synthase A  36.02 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  35.32 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 276 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  35.63 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  36.91 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  35.29 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  36.64 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  36.11 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.08 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  37.66 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1129  tRNA pseudouridine synthase A  36.82 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>