More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0357 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  75 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  63.79 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  62.93 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  62.93 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  62.93 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  62.93 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  61.02 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  62.07 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  61.21 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  58.47 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  40.65 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  42.98 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  42.98 
 
 		 238 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  42.98 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  42.98 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  42.98 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.27 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  42.98 
 
 		 374 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  42.98 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  40.34 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  39.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  39.17 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  39.17 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  38.26 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  39.47 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  40.21 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.82 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.77 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  36.44 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  35.09 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.53 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  39.13 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  37.93 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  38.54 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  38.26 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  35.34 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>