More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1803 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  100 
 
 		 389 aa  799    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  80.31 
 
 		 388 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  50.26 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  50.26 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  50 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.74 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.74 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  49.74 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  50.26 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  39.32 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  39.02 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  40.45 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.56 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.37 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  39.48 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  39.36 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  36.48 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  38.06 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  38.02 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  37.24 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.24 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.4 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  38.04 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  36.24 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.2 
 
 		 378 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  37.27 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  38.46 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.46 
 
 		 385 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.37 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  38.62 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  38.36 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.74 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  37.3 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  37.76 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.82 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  37 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  35.38 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  37.6 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  38.52 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  36.8 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.31 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.19 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  37.67 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.95 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.71 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.71 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.5 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  34.36 
 
 		 379 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  37.6 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  34.36 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  35.43 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  38.12 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  37.22 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  37 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.9 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  35.7 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.98 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.05 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  34.82 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.95 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.73 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  35.57 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.99 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  36.41 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37.21 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  34.79 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.98 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.38 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.03 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.81 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.18 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.41 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.42 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  42.02 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.94 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.54 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  31.39 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.36 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.25 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.59 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.65 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.64 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.17 
 
 		 397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.65 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.9 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>