174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1175 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
533 aa  1105    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.72 
 
 
634 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.27 
 
 
790 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.22 
 
 
795 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.03 
 
 
553 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  47 
 
 
609 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.17 
 
 
542 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.64 
 
 
762 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.81 
 
 
775 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.3 
 
 
905 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.08 
 
 
618 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.22 
 
 
766 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 
772 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  41.34 
 
 
777 aa  439  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  43.46 
 
 
795 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.34 
 
 
605 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.92 
 
 
613 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  41.48 
 
 
776 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.86 
 
 
526 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  44.32 
 
 
736 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.64 
 
 
774 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.88 
 
 
765 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.83 
 
 
779 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.54 
 
 
618 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.56 
 
 
781 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.97 
 
 
549 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.87 
 
 
527 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.25 
 
 
779 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 
785 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.11 
 
 
655 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.74 
 
 
760 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.16 
 
 
812 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.86 
 
 
821 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.61 
 
 
534 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.63 
 
 
534 aa  365  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.46 
 
 
812 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.31 
 
 
834 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.27 
 
 
546 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.31 
 
 
505 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.29 
 
 
639 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.03 
 
 
469 aa  327  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 
637 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  34.62 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
525 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 
529 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 
665 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.63 
 
 
614 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.01 
 
 
543 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 
547 aa  293  7e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.77 
 
 
422 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
628 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  38.06 
 
 
602 aa  283  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.99 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 
549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
636 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  32.94 
 
 
639 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.23 
 
 
683 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 
636 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.69 
 
 
545 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.6 
 
 
639 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
688 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 
528 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.72 
 
 
688 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.67 
 
 
558 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.55 
 
 
816 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 
584 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 
593 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.94 
 
 
794 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 
481 aa  250  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 
515 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 
447 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 
820 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.39 
 
 
525 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.79 
 
 
533 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.37 
 
 
807 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 
673 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 
858 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
676 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
673 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.64 
 
 
797 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.93 
 
 
811 aa  210  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 
1140 aa  209  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.43 
 
 
778 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.68 
 
 
504 aa  196  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 
852 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
500 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 
863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  30.62 
 
 
889 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
853 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
518 aa  183  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.6 
 
 
857 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.08 
 
 
868 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.24 
 
 
530 aa  178  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.22 
 
 
866 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.91 
 
 
913 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.67 
 
 
489 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
913 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 
910 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>