More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5032 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  61.5 
 
 		 1598 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  49.25 
 
 		 1388 aa  1169    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  61.64 
 
 		 1599 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  71.23 
 
 		 1434 aa  1974    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.09 
 
 		 1412 aa  1462    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  61.5 
 
 		 1598 aa  1001    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.3 
 
 		 1426 aa  1979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.33 
 
 		 1505 aa  1910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  49.37 
 
 		 1419 aa  1150    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  61.75 
 
 		 1700 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 1431 aa  2865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  35.18 
 
 		 1523 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  67.1 
 
 		 1515 aa  1125    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.14 
 
 		 1480 aa  1898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  60.61 
 
 		 1626 aa  1009    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.78 
 
 		 1518 aa  1918    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  69 
 
 		 1510 aa  1988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  61.73 
 
 		 1598 aa  996    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  36.01 
 
 		 1480 aa  681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  34.69 
 
 		 1531 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  47.06 
 
 		 1435 aa  1221    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.18 
 
 		 1451 aa  2011    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  69.63 
 
 		 1504 aa  2006    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.89 
 
 		 1508 aa  1816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  68.62 
 
 		 1448 aa  1935    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  69.03 
 
 		 1448 aa  1933    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.55 
 
 		 1497 aa  1974    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.16 
 
 		 1475 aa  1183    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  61.5 
 
 		 1598 aa  1001    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.88 
 
 		 1429 aa  1976    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  61.5 
 
 		 1598 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  50.56 
 
 		 1573 aa  1062    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  33.71 
 
 		 1544 aa  635  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  34.96 
 
 		 1506 aa  636  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  34.54 
 
 		 1536 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  35.14 
 
 		 1536 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  35.27 
 
 		 1536 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  34.14 
 
 		 1567 aa  615  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  33.33 
 
 		 1604 aa  612  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 1516 aa  612  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 		 1553 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.99 
 
 		 1476 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 		 1613 aa  606  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.17 
 
 		 1539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.89 
 
 		 1620 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 1523 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  34.53 
 
 		 1535 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 		 1514 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.5 
 
 		 1561 aa  596  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  32.7 
 
 		 1523 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 1523 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  33.57 
 
 		 1584 aa  589  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  34.36 
 
 		 1513 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  33.92 
 
 		 1509 aa  588  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  33.91 
 
 		 1632 aa  588  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  33.46 
 
 		 1549 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 		 1517 aa  581  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  33.95 
 
 		 1572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  34.63 
 
 		 1606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  33.65 
 
 		 1493 aa  579  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.55 
 
 		 1538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  32.32 
 
 		 1649 aa  566  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.66 
 
 		 1538 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.53 
 
 		 1538 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.46 
 
 		 1538 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.53 
 
 		 1525 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.48 
 
 		 1538 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1538 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.46 
 
 		 1538 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  30.88 
 
 		 1618 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00432  ATP-dependent DNA helicase  68.24 
 
 		 398 aa  542  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  32.08 
 
 		 1601 aa  535  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  35.71 
 
 		 1688 aa  506  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  31.36 
 
 		 1379 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.55 
 
 		 1534 aa  493  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1381 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  34.4 
 
 		 1534 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.14 
 
 		 1502 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  34.83 
 
 		 1495 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 		 1694 aa  452  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.7 
 
 		 875 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.69 
 
 		 888 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  34.03 
 
 		 1729 aa  449  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.46 
 
 		 873 aa  441  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  32.03 
 
 		 874 aa  416  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  31.92 
 
 		 874 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  31.92 
 
 		 874 aa  413  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  34.22 
 
 		 922 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  30.73 
 
 		 872 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  33.94 
 
 		 872 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.16 
 
 		 870 aa  406  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  31.13 
 
 		 1694 aa  403  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  34.17 
 
 		 915 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  32.8 
 
 		 1644 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  33.22 
 
 		 914 aa  390  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  27.98 
 
 		 1577 aa  386  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  33.11 
 
 		 941 aa  383  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  31.5 
 
 		 1523 aa  352  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 		 900 aa  349  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00430  ATP-dependent DNA helicase  50.14 
 
 		 447 aa  329  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.774826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>