101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3805 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 179 aa  357  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  60.23 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  32.78 
 
 		 190 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.13 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.97 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  29.51 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.45 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  30.99 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.71 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  35.38 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  28.08 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  28.17 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  24.32 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  23.12 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.17 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25.37 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  24.48 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.37 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  29.78 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  24.83 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  29.12 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  25.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  22.08 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.82 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  34.26 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  33.7 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  26.47 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  24.6 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.16 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  24.53 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.47 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  28.24 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  24.39 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  25.54 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.62 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.34 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.93 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 132 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  34 
 
 		 118 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.21 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  29.6 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  29.6 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  29.6 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  29.6 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  28.77 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>