282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0353 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0353  permease  100 
 
 		 352 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  50.43 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  52.41 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  50.54 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  49.86 
 
 		 356 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  49.43 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  47.83 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  46.03 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  43.92 
 
 		 365 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  40.78 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  44.9 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  65.25 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  40.73 
 
 		 350 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  38.87 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  37.91 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  34.65 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  44.86 
 
 		 475 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  34.44 
 
 		 620 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  45.81 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  43.05 
 
 		 433 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  45.14 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  48.92 
 
 		 490 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  51.41 
 
 		 510 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  49.6 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  46.99 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  46.99 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  46.67 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  46.67 
 
 		 500 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  27.16 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  47.62 
 
 		 495 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  46.54 
 
 		 509 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  51.91 
 
 		 501 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  51.91 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  28.76 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  51.91 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  50.77 
 
 		 491 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  29.39 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  25.7 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  26.23 
 
 		 302 aa  89.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  24.21 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  24.63 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  25.27 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  23.13 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  24.3 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  24.55 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  25.56 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  24.48 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  25.9 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  25.57 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.48 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.9 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  25.3 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  24.15 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.02 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  27.4 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  25.19 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  25.97 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.79 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.59 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  25.09 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.97 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.22 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.47 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  25.1 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  24.38 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  23.32 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  24.71 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  28.63 
 
 		 714 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  25.39 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  26.05 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  25.87 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.69 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  27.27 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.67 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.06 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  24.41 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  25.33 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  25 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  23.44 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  26.29 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  24.71 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  24.39 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  26.06 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  23.94 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  23.29 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  22.97 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.97 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  22.97 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  24.39 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.26 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  26.16 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  24.92 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  23.49 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  24.76 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25.19 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.16 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  22.34 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  24.73 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.12 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  26.32 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>