More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0025 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  100 
 
 
157 aa  320  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 
159 aa  218  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  67.33 
 
 
161 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  61.18 
 
 
155 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  65.33 
 
 
158 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  65.79 
 
 
155 aa  210  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  63.33 
 
 
157 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  54.67 
 
 
153 aa  173  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  49.21 
 
 
154 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  41.98 
 
 
136 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 
137 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.82 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  35.83 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 
120 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  36.75 
 
 
123 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.82 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
361 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.04 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  35.4 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  32.77 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.02 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  30.09 
 
 
455 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  26.61 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 
369 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.01 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
393 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 
480 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
346 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  26.56 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.34 
 
 
389 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 
190 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  35.65 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  29.75 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  61.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  34.82 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.26 
 
 
383 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  28.1 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.52 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.71 
 
 
480 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  30.93 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.21 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.03 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 
354 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32.65 
 
 
389 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  31.97 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
221 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
221 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
647 aa  58.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  30.83 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.63 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 
568 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.18 
 
 
133 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
383 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 
119 aa  57.4  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>