More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3590 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  64.68 
 
 		 221 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  64.22 
 
 		 221 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  50.72 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.95 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  47.44 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  47.2 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.19 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.44 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  41.2 
 
 		 241 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  36.92 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  37.38 
 
 		 228 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  44.86 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.07 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  50.77 
 
 		 142 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  40.72 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.55 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.68 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.1 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.81 
 
 		 246 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.27 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.43 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.54 
 
 		 456 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.18 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.02 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.43 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 456 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.56 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  28.85 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.56 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.37 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.02 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1198  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.21 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.54 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  33.68 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.62 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 247 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.33 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.95 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.22 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  32.45 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  34.67 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.64 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.67 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  31.82 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.17 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.95 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.47 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.94 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  45.28 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.43 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.71 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>