More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82821 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  72.6 
 
 
563 aa  677    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82821  DEAD box RNA helicase  100 
 
 
530 aa  1100    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283146  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01240  p68-like protein, putative  67.67 
 
 
540 aa  634  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  61.89 
 
 
529 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27227  predicted protein  51.64 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.689197 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36611  predicted protein  51.64 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438813  decreased coverage  0.000242961 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  42.29 
 
 
1173 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  50.52 
 
 
413 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38084  predicted protein  47.47 
 
 
440 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87539  pre-mRNA processing RNA-helicase  41.25 
 
 
875 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.223181 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  48.87 
 
 
421 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34710  predicted protein  43.19 
 
 
723 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.628608  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01970  pre-mRNA splicing factor, putative  39.45 
 
 
1072 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  43.61 
 
 
552 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  43.77 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  42.37 
 
 
526 aa  336  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  45.8 
 
 
394 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  43.24 
 
 
616 aa  333  6e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  40.5 
 
 
668 aa  332  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10782  predicted protein  43.57 
 
 
417 aa  322  8e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  42.39 
 
 
637 aa  318  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01650  conserved hypothetical protein  41.05 
 
 
615 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12990  predicted protein  40.32 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18199  predicted protein  45.91 
 
 
595 aa  306  8.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  41.45 
 
 
452 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.63 
 
 
504 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 
497 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.26 
 
 
482 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.26 
 
 
482 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.04 
 
 
559 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
482 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
482 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
482 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
481 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00590  conserved hypothetical protein  42.67 
 
 
605 aa  299  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1114  predicted protein  42.32 
 
 
478 aa  299  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0466739  normal  0.893767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.04 
 
 
571 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  41.98 
 
 
533 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  39.17 
 
 
469 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.07 
 
 
449 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.4 
 
 
473 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.91 
 
 
453 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.37 
 
 
459 aa  296  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.62 
 
 
479 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  38.69 
 
 
477 aa  296  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.58 
 
 
511 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  40.33 
 
 
527 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.01 
 
 
493 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.95 
 
 
556 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.78 
 
 
482 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.53 
 
 
453 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.48 
 
 
448 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.86 
 
 
509 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.18 
 
 
474 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.65 
 
 
520 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.6 
 
 
491 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.22 
 
 
479 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.43 
 
 
489 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  38.65 
 
 
520 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.65 
 
 
520 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.66 
 
 
423 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  41.2 
 
 
482 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.75 
 
 
493 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  38.57 
 
 
481 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.37 
 
 
497 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01634  Pre-mRNA-splicing ATP-dependent RNA helicase prp28 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCU6]  34.56 
 
 
782 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.27 
 
 
537 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  42.86 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  40.73 
 
 
491 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  41.24 
 
 
495 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.86 
 
 
454 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.08 
 
 
450 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  39.18 
 
 
476 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.54 
 
 
460 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.62 
 
 
484 aa  287  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  41.55 
 
 
510 aa  286  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
471 aa  286  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.06 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  38.9 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.62 
 
 
484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.95 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.48 
 
 
545 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.02 
 
 
550 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.59 
 
 
463 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.9 
 
 
559 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.38 
 
 
464 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.19 
 
 
479 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.71 
 
 
551 aa  281  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 
405 aa  281  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  38.42 
 
 
498 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.91 
 
 
489 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.52 
 
 
486 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  37.95 
 
 
575 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.86 
 
 
456 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.44 
 
 
479 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 
499 aa  280  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.5 
 
 
584 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.81 
 
 
521 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.16 
 
 
506 aa  279  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 
494 aa  279  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>