More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26813 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_26813  predicted protein  100 
 
 
456 aa  927    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996098  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48694  predicted protein  47.04 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 
432 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 
431 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
431 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
431 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
431 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 
431 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
431 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
431 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 
431 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
442 aa  257  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 
431 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 
431 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
431 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
431 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.08 
 
 
431 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
417 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
417 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
432 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  36.3 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 
434 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 
434 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 
434 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 
434 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 
431 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  35.59 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.41 
 
 
428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 
428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 
438 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  37.66 
 
 
441 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
428 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 
430 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  36.74 
 
 
441 aa  237  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
433 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 
427 aa  237  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 
424 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 
438 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 
433 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  33.88 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  35.36 
 
 
434 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 
441 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  34.66 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 
441 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 
434 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  37.77 
 
 
433 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 
441 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 
438 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 
448 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  32.08 
 
 
440 aa  230  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  35.95 
 
 
438 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  32.53 
 
 
431 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 
437 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
437 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
437 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 
436 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 
425 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0834  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 
420 aa  227  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 
437 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 
432 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
417 aa  226  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 
432 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 
435 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  34.11 
 
 
424 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  32.48 
 
 
439 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 
408 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 
438 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 
418 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 
420 aa  224  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  35.58 
 
 
433 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  36.06 
 
 
437 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  33.03 
 
 
443 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  33.8 
 
 
441 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  34.61 
 
 
436 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  35.16 
 
 
445 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  34.26 
 
 
436 aa  223  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  33.18 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  33.95 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  32.53 
 
 
422 aa  221  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 
410 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 
438 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  32.87 
 
 
434 aa  220  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 
438 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  32.71 
 
 
439 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 
431 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0284  homoserine dehydrogenase  33.74 
 
 
441 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 
442 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  38.29 
 
 
440 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>