More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23324 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  100 
 
 
176 aa  362  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  68.97 
 
 
175 aa  258  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  67.43 
 
 
177 aa  253  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  66.67 
 
 
175 aa  243  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  68.39 
 
 
174 aa  236  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  43.03 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  42.59 
 
 
179 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  46.01 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  40.61 
 
 
174 aa  142  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  45.12 
 
 
181 aa  141  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  42.33 
 
 
169 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  41.98 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  39.89 
 
 
178 aa  139  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.66 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  42.6 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  42.01 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  41.36 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  42.6 
 
 
181 aa  134  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  40.37 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  40.74 
 
 
178 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  40.65 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  43.67 
 
 
171 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  41.36 
 
 
179 aa  130  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  40.74 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  40 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  39.77 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  35.71 
 
 
174 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  35.62 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  41.77 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  39.75 
 
 
181 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  37.71 
 
 
179 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  38.82 
 
 
175 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  41.98 
 
 
179 aa  124  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  34.56 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  34.38 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  33.76 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  32.48 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  32.69 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  32.47 
 
 
243 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  34.39 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  33.09 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  32.47 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  32.12 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  34.56 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  32.35 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  33.57 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  30.88 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  31.76 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  34.31 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  32.87 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  34.31 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  32.87 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  32.87 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  32.87 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  32.87 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  34.31 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  29.93 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  29.93 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  33.82 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  29.41 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  30.66 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  34.31 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  32.17 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  32.12 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  31.76 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  29.93 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  32.35 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  32.12 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  27.74 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  27.74 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  27.74 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  27.74 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>