More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21789 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  61.47 
 
 
538 aa  704    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  56.91 
 
 
567 aa  655    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  100 
 
 
559 aa  1153    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  60 
 
 
553 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  60 
 
 
553 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  57.3 
 
 
527 aa  657    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  41.37 
 
 
543 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  38.39 
 
 
570 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  37.61 
 
 
557 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  39.38 
 
 
553 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  37.98 
 
 
543 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  38.13 
 
 
551 aa  377  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  40.14 
 
 
553 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  37.75 
 
 
543 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  37.64 
 
 
563 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  37.57 
 
 
560 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  38.72 
 
 
545 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  39.93 
 
 
551 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  36.25 
 
 
555 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.32 
 
 
551 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  38.07 
 
 
558 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  39.35 
 
 
552 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  36.68 
 
 
542 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  36.65 
 
 
557 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  36.28 
 
 
559 aa  365  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  37.5 
 
 
558 aa  363  3e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  38.77 
 
 
548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  38.39 
 
 
539 aa  363  6e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  37.82 
 
 
554 aa  362  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  37.5 
 
 
560 aa  362  1e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  38.16 
 
 
543 aa  360  3e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  38.52 
 
 
547 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  37.36 
 
 
553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  35.03 
 
 
540 aa  356  5e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  36.84 
 
 
542 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  37.14 
 
 
542 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  36.78 
 
 
545 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  36.9 
 
 
558 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  38.16 
 
 
549 aa  350  5e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  38.81 
 
 
552 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  38.41 
 
 
550 aa  348  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  38.04 
 
 
554 aa  347  4e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  34.34 
 
 
559 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  34.66 
 
 
558 aa  342  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  35.39 
 
 
554 aa  335  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  34.41 
 
 
562 aa  333  4e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  35.51 
 
 
554 aa  327  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  35.15 
 
 
541 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  34.81 
 
 
553 aa  321  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  35.36 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  34.12 
 
 
552 aa  307  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  33.27 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.33 
 
 
537 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  34.78 
 
 
561 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  31.29 
 
 
570 aa  299  9e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  33.7 
 
 
535 aa  299  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.48 
 
 
529 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.73 
 
 
532 aa  294  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.39 
 
 
530 aa  292  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  33.51 
 
 
548 aa  290  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.94 
 
 
527 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  32.44 
 
 
560 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  31.4 
 
 
577 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.27 
 
 
536 aa  287  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  32.67 
 
 
542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.85 
 
 
519 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.92 
 
 
546 aa  280  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.85 
 
 
525 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  31.85 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  30.44 
 
 
563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.25 
 
 
528 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.02 
 
 
555 aa  269  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  31.5 
 
 
528 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.52 
 
 
525 aa  260  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  31.93 
 
 
550 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  32.4 
 
 
536 aa  257  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  31.68 
 
 
548 aa  257  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  31.59 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.19 
 
 
529 aa  253  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  30.94 
 
 
558 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  32.16 
 
 
536 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  31.18 
 
 
553 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  31.31 
 
 
542 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  30.25 
 
 
551 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  31.11 
 
 
548 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  31.84 
 
 
527 aa  237  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  30.7 
 
 
533 aa  227  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  28.81 
 
 
530 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  28.24 
 
 
568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  29.34 
 
 
531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  26.95 
 
 
558 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  29.28 
 
 
527 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  25.09 
 
 
552 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  28.91 
 
 
523 aa  206  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  28.68 
 
 
581 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  29 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  26.57 
 
 
539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  27.75 
 
 
547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  25.72 
 
 
541 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  26.86 
 
 
534 aa  197  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>