167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2170 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2170  sugar transporter  100 
 
 		 429 aa  849    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  67.68 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  29.66 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.05 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  27.29 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  28.48 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  28.24 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  28.24 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  28.24 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.51 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.87 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  28.51 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  28.19 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.21 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  28.97 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  28.74 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  26.64 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  27.78 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  29.19 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  25.93 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  28.06 
 
 		 429 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  29.5 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  27.13 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  27.13 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  27.13 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.15 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  27.13 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  27.33 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  26.9 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  27.23 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  27.58 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  28.1 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.32 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  28.28 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  27.4 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  27.27 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.25 
 
 		 403 aa  126  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  28.05 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  28.87 
 
 		 406 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  26.79 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  27.36 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  25.94 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  29.19 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  28.01 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.7 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  28.05 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  27.56 
 
 		 437 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  26.24 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  27.14 
 
 		 429 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  25.62 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  25.68 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  25.55 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  27.21 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.55 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  28.6 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  25.4 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  28.8 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  25.85 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  26.07 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  26.61 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  27.27 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.35 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  27.51 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  24.39 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  25.45 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.42 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.74 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.05 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  26.85 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  25.73 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  24.16 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.06 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  25.37 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  25.53 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  27.38 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  23.09 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.56 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  24.59 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  24.56 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  25.5 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  24.47 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  22.42 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  27.45 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  23.04 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  23.94 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  25.89 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>