198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3979 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  48.45 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  48.32 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  48.32 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  47.79 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  44.74 
 
 		 190 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  44.74 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  42.77 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  40.76 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  42.48 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  39.38 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  42.48 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  38.99 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  41.72 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  37.96 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  34.13 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  35.62 
 
 		 560 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  36.7 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  31.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  33.57 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.13 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  32.82 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  29.51 
 
 		 1202 aa  55.1  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.13 
 
 		 572 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.71 
 
 		 567 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.83 
 
 		 444 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.47 
 
 		 446 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.56 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.67 
 
 		 428 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  38.89 
 
 		 1078 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 631 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.45 
 
 		 1028 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  29.06 
 
 		 1077 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.08 
 
 		 440 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  33.33 
 
 		 956 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.92 
 
 		 431 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.64 
 
 		 1059 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  33.63 
 
 		 457 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.07 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.75 
 
 		 432 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 431 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1021 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25.16 
 
 		 432 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.03 
 
 		 431 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 439 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 431 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 431 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.74 
 
 		 450 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.09 
 
 		 590 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.42 
 
 		 442 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 463 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  37.21 
 
 		 982 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 430 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 430 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  28.57 
 
 		 629 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.41 
 
 		 449 aa  48.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  32 
 
 		 440 aa  48.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.47 
 
 		 445 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  27.08 
 
 		 430 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  26.83 
 
 		 441 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 463 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.61 
 
 		 442 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.06 
 
 		 446 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 463 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.69 
 
 		 428 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 431 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  36.96 
 
 		 347 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  27.08 
 
 		 430 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.44 
 
 		 442 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.4 
 
 		 437 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  30 
 
 		 698 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  25 
 
 		 433 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.83 
 
 		 443 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0250  hypothetical protein  31.71 
 
 		 399 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  29.86 
 
 		 438 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  28.69 
 
 		 437 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  25 
 
 		 463 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  25 
 
 		 433 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  29.91 
 
 		 1010 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  36.28 
 
 		 433 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 433 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  35.9 
 
 		 442 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  29.03 
 
 		 453 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.2 
 
 		 421 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.42 
 
 		 976 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  35.4 
 
 		 433 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.12 
 
 		 497 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  25.35 
 
 		 620 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  28.35 
 
 		 416 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 428 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 434 aa  45.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 428 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  26.61 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>