More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5758 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
815 aa  1628    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  41.7 
 
 
825 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  41.34 
 
 
825 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 
817 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  40.53 
 
 
860 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 
862 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 
850 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 
837 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  38.39 
 
 
843 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 
864 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 
859 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
726 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 
726 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
743 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 
726 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.61 
 
 
708 aa  350  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.01 
 
 
703 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 
730 aa  343  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
708 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
710 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  35.75 
 
 
689 aa  336  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 
711 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 
821 aa  327  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
722 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
734 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
741 aa  324  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
709 aa  323  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 
721 aa  321  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
819 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 
712 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 
738 aa  316  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 
701 aa  314  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 
689 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
736 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.07 
 
 
709 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
715 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
708 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
829 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 
707 aa  309  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
757 aa  308  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 
722 aa  307  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 
714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.04 
 
 
703 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.28 
 
 
696 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 
696 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 
732 aa  300  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
771 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
812 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
710 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
713 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 
701 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.53 
 
 
801 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
701 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
701 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.8 
 
 
711 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
778 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 
703 aa  293  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 
771 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 
829 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  31.01 
 
 
747 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
792 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.33 
 
 
703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 
799 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.87 
 
 
747 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 
722 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 
709 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 
831 aa  286  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
692 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
793 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 
797 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.26 
 
 
729 aa  285  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 
806 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.32 
 
 
745 aa  283  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  30.59 
 
 
747 aa  283  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.38 
 
 
747 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 
710 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  30.4 
 
 
752 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
724 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 
791 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.24 
 
 
747 aa  280  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.62 
 
 
747 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 
724 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  30.61 
 
 
791 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 
702 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 
702 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
723 aa  278  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  29.9 
 
 
729 aa  276  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
701 aa  276  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 
677 aa  274  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
714 aa  273  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
714 aa  273  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.16 
 
 
799 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
701 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 
769 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>