118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0998 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  62.24 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  49.47 
 
 		 99 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  50.52 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  43 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  38.78 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  37.89 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  39.18 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  48.61 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  40.62 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  38.54 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  51.61 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  44.16 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  39.19 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  43.68 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  29.59 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  29.21 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  48.84 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  37.33 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  46.55 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  46.55 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  33.73 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  31.82 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  37.04 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  30.12 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  32.61 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  33.8 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  55.56 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  37.35 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  32 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  27.38 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  29.55 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  29.55 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  32.1 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  33.77 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2185  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  28.24 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>