More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47880  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000178644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4127  putative transcriptional regulator  97.22 
 
 		 294 aa  540  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3678  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1800  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.18 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0656  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3628  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3353  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5014  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5273  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4427  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.14 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0278  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3936  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  32.52 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0276  transcriptional regulator, LysR family protein  28.67 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160059  hitchhiker  0.0000019997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2226  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0492432  normal  0.299524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2149  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269804  normal  0.274984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  30.27 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4760  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0258  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  30.99 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3532  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  34.77 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  29.76 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0258  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>