More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01571 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  58.01 
 
 		 319 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  55.62 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  56.25 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  39.2 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  39.2 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  33.79 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  36.36 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  33.86 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  33.66 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  33.66 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  29.72 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.38 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  28.21 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  30.41 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  31.14 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  30.67 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  33.22 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.14 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.44 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  34.98 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.65 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.96 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.23 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  35.09 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.76 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.76 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.49 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.95 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.88 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.12 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  28.95 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.98 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  25.69 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  29.65 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  29.65 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.15 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  29.15 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  29.15 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.75 
 
 		 358 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  30.46 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  28.08 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.32 
 
 		 344 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  26.83 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 		 374 aa  89  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.92 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.61 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  31.82 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.68 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.34 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  32.34 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  31.82 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  28.71 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.29 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  28.63 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  29.8 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  27.23 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  29.8 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 		 737 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  28.9 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.53 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.85 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  30.41 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  31.69 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  27.09 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.23 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.69 
 
 		 460 aa  82.8  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  31.52 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  32.89 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  31.82 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  27.1 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.21 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  25.1 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  24.9 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  29.53 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  29.53 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  30.2 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.18 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.46 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.17 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32 
 
 		 575 aa  80.1  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  27.35 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>