159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2564 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2564  ribonuclease BN  100 
 
 		 541 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.110127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  25.55 
 
 		 449 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  23.13 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  28.38 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  26.94 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.13 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 499 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  26.4 
 
 		 447 aa  94  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  26.44 
 
 		 411 aa  93.6  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  30.61 
 
 		 437 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  24.86 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  28.86 
 
 		 439 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 436 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  29.06 
 
 		 437 aa  91.3  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  29.06 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 439 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  29.06 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  29.06 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  30.4 
 
 		 451 aa  91.3  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  29.06 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  29.06 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 443 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  28.86 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.9 
 
 		 404 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  23.3 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  28.29 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  22.97 
 
 		 446 aa  87  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  27.38 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  32.83 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  28.08 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.08 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  26.1 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  27.37 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  27.7 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  31.77 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  25.76 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  23.53 
 
 		 451 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  32.07 
 
 		 416 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  30.41 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.41 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  30.41 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.41 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  33.16 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  30.05 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  27.65 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  33.16 
 
 		 323 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  33.16 
 
 		 323 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  33.16 
 
 		 323 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  23.88 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.84 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  28.15 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  27.59 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  33.17 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  29.61 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.26 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  34.55 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  27.1 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  25.32 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  26.64 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  30.3 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.29 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  28.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  25.93 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.47 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  26.57 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  25 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  23.7 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  23.81 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.54 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  30.93 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.61 
 
 		 408 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  28.42 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 443 aa  67  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  26.47 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  26.23 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  26.57 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  30.93 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  26.14 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>