More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_87451 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  61.15 
 
 
535 aa  648    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  100 
 
 
527 aa  1071    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  59.32 
 
 
529 aa  624  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  57.42 
 
 
536 aa  615  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  59.06 
 
 
533 aa  595  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  41.63 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  41.49 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  44.22 
 
 
539 aa  404  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  41.41 
 
 
570 aa  388  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  39.85 
 
 
551 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  40.24 
 
 
540 aa  378  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  39.8 
 
 
543 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  40.79 
 
 
560 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  40.98 
 
 
545 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  40.59 
 
 
553 aa  369  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  40.77 
 
 
551 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  40.51 
 
 
552 aa  361  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.9 
 
 
551 aa  360  5e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  38.39 
 
 
557 aa  359  7e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  39.45 
 
 
543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  40 
 
 
558 aa  356  5.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  40.87 
 
 
500 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  39.13 
 
 
554 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  39.8 
 
 
547 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  38.2 
 
 
559 aa  350  5e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  37.62 
 
 
545 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  37.8 
 
 
563 aa  348  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  40.59 
 
 
548 aa  347  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  38.24 
 
 
543 aa  347  4e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  37.62 
 
 
542 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  36.61 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  37.62 
 
 
542 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  39.23 
 
 
562 aa  343  5.999999999999999e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  39.37 
 
 
554 aa  342  7e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  39.49 
 
 
553 aa  342  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  37.75 
 
 
553 aa  341  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  37.43 
 
 
543 aa  340  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  38.78 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  40.16 
 
 
552 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  39.17 
 
 
560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  36.81 
 
 
559 aa  333  6e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  36.22 
 
 
558 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  40.24 
 
 
549 aa  332  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  40.59 
 
 
550 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  40 
 
 
554 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  37.04 
 
 
541 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.19 
 
 
527 aa  326  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.48 
 
 
529 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  39.57 
 
 
553 aa  324  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  36.79 
 
 
535 aa  325  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.52 
 
 
548 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  38.24 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  37.18 
 
 
550 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.82 
 
 
530 aa  317  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.26 
 
 
548 aa  316  6e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  35.04 
 
 
547 aa  315  9e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.66 
 
 
532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  35.88 
 
 
552 aa  312  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  36.76 
 
 
558 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.59 
 
 
536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.71 
 
 
554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  36.2 
 
 
536 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  35.49 
 
 
561 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.66 
 
 
537 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  34.71 
 
 
548 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.36 
 
 
555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.14 
 
 
546 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  33.72 
 
 
542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  31.93 
 
 
538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.66 
 
 
570 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  33.2 
 
 
553 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  33.2 
 
 
553 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.08 
 
 
523 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 
567 aa  257  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.07 
 
 
528 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  32.58 
 
 
542 aa  253  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  29.85 
 
 
527 aa  252  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.46 
 
 
519 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  32.64 
 
 
530 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  30.61 
 
 
558 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  32.2 
 
 
551 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.11 
 
 
560 aa  246  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.75 
 
 
525 aa  246  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.43 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  30.68 
 
 
528 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  31.84 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.14 
 
 
527 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  31.59 
 
 
531 aa  239  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  29.72 
 
 
568 aa  236  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  30.23 
 
 
553 aa  234  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  30.13 
 
 
526 aa  234  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  31.24 
 
 
577 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  29.63 
 
 
547 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  27.94 
 
 
581 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  29.35 
 
 
558 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  30.43 
 
 
563 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  26.76 
 
 
541 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  27.52 
 
 
549 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  30.49 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.28 
 
 
564 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>