More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2645 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  100 
 
 
532 aa  1084    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  39.55 
 
 
524 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  37.43 
 
 
534 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 
528 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  35.62 
 
 
535 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.32 
 
 
520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  35.12 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  36.49 
 
 
565 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.81 
 
 
535 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  33.79 
 
 
535 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  35.81 
 
 
535 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.67 
 
 
509 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  34.26 
 
 
535 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 
535 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 
535 aa  290  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  34.61 
 
 
575 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
528 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  34.13 
 
 
526 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  34.13 
 
 
526 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  34.13 
 
 
526 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  34.13 
 
 
526 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 
532 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  33.93 
 
 
535 aa  279  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.93 
 
 
535 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  33.93 
 
 
535 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  33.93 
 
 
526 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
535 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
535 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  31.12 
 
 
521 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.5 
 
 
521 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.5 
 
 
521 aa  267  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.5 
 
 
521 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
521 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
506 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
530 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  33.13 
 
 
523 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
541 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  29.35 
 
 
541 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
541 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  32.4 
 
 
531 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 
531 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  31.37 
 
 
588 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  33.27 
 
 
540 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
551 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
525 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
531 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
532 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 
546 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
525 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
525 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  33.2 
 
 
537 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
547 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.71 
 
 
531 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
530 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
542 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
531 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  32.88 
 
 
537 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
595 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
541 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.19 
 
 
556 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
538 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.75 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.7 
 
 
530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 
531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.93 
 
 
532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
545 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 
542 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.95 
 
 
525 aa  243  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
529 aa  243  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  32.8 
 
 
542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  31.98 
 
 
533 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
541 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 
543 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.8 
 
 
542 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 
531 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
582 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
589 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 
542 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.26 
 
 
532 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 
532 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.15 
 
 
531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.86 
 
 
526 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 
532 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  32.78 
 
 
547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.52 
 
 
566 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
547 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 
528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>