More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2903 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  73.8 
 
 		 585 aa  888    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  100 
 
 		 574 aa  1182    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  78.71 
 
 		 587 aa  964    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  82.06 
 
 		 574 aa  995    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  89.35 
 
 		 574 aa  1071    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  52.17 
 
 		 815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  50.91 
 
 		 814 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  51.25 
 
 		 808 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  50.18 
 
 		 816 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  49.74 
 
 		 822 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  56.12 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  54.07 
 
 		 633 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  52.11 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  53.47 
 
 		 908 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  49.48 
 
 		 891 aa  504  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  45.97 
 
 		 860 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  48.92 
 
 		 824 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  52.57 
 
 		 523 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  52.57 
 
 		 508 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  52.84 
 
 		 873 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  46.11 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  47.8 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  43.8 
 
 		 523 aa  410  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  45.9 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  45.59 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  45.78 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  45.47 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  44.72 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  44.92 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  43.58 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  41.38 
 
 		 508 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  41.84 
 
 		 810 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  42.68 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  43.83 
 
 		 526 aa  359  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  42.35 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.56 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  43.04 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  40.92 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  43.48 
 
 		 499 aa  350  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  39.91 
 
 		 492 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  40.64 
 
 		 526 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  40.95 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  40.04 
 
 		 810 aa  342  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  40.28 
 
 		 527 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  38.84 
 
 		 527 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  38.93 
 
 		 847 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  38.66 
 
 		 809 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  40.76 
 
 		 493 aa  336  7.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  40.34 
 
 		 504 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  40.37 
 
 		 814 aa  332  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  40.32 
 
 		 505 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.38 
 
 		 708 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  40 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  39.49 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  39.08 
 
 		 814 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  38.34 
 
 		 808 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  37.16 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  35.31 
 
 		 799 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  37.81 
 
 		 522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  38.58 
 
 		 827 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  38.49 
 
 		 516 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  38.4 
 
 		 527 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  37.05 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  37 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  37.61 
 
 		 522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  38.2 
 
 		 513 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  37.6 
 
 		 523 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  37.37 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  37.37 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  35.26 
 
 		 871 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  37.33 
 
 		 799 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  37.92 
 
 		 680 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  33.9 
 
 		 544 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  35.35 
 
 		 547 aa  287  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  35.92 
 
 		 853 aa  283  8.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  34.02 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  34.02 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.16 
 
 		 855 aa  281  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  35.85 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  33.15 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  36.71 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  36.05 
 
 		 540 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 		 518 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  36.82 
 
 		 564 aa  277  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 		 518 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  34.96 
 
 		 510 aa  276  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  37.18 
 
 		 541 aa  276  9e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  34.94 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  33.27 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  38.25 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  38.25 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.15 
 
 		 503 aa  274  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  38.34 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  34.68 
 
 		 856 aa  272  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  33.79 
 
 		 862 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  37.36 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  35.53 
 
 		 544 aa  272  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  35.34 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  36.34 
 
 		 498 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  36.61 
 
 		 511 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>