More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1260 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 755 aa  1546    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  53.08 
 
 		 727 aa  731    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  47.38 
 
 		 771 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  44.53 
 
 		 724 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  44.38 
 
 		 705 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  45.36 
 
 		 724 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 719 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 735 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  42.79 
 
 		 755 aa  499  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 756 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  40.27 
 
 		 707 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 792 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 693 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 694 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 715 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 770 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 710 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 710 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 719 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 709 aa  327  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 757 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  32.23 
 
 		 695 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 745 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 860 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 726 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 689 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 734 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 734 aa  280  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 742 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 742 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 708 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 736 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 700 aa  277  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 		 726 aa  277  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 689 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 726 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 732 aa  274  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 732 aa  273  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 698 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 743 aa  267  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 821 aa  266  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 708 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 711 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.96 
 
 		 711 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 799 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 769 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 747 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.53 
 
 		 709 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.27 
 
 		 801 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 751 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.12 
 
 		 753 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 712 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.56 
 
 		 680 aa  250  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 740 aa  250  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 817 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 753 aa  250  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 734 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  30.83 
 
 		 772 aa  249  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 837 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 749 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 766 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 748 aa  247  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 748 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  29.99 
 
 		 748 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 748 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 710 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 747 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 747 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 747 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 732 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 747 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 747 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 749 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 714 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 733 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 806 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 779 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 736 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  30.96 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.56 
 
 		 833 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.59 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 862 aa  237  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 730 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 689 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 733 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.34 
 
 		 703 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 820 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 722 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 730 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>