More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0019 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  100 
 
 
404 aa  811    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  89.37 
 
 
401 aa  722    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  82.63 
 
 
388 aa  650    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  50.53 
 
 
413 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  54.03 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  51.59 
 
 
393 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  54.81 
 
 
396 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  54.81 
 
 
396 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  51.51 
 
 
381 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  53.08 
 
 
376 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  51.08 
 
 
369 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  48.29 
 
 
391 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  51.38 
 
 
367 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  50.65 
 
 
393 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  50.67 
 
 
373 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  49.87 
 
 
382 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.21 
 
 
394 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
373 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  50.27 
 
 
394 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  49.87 
 
 
379 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  48.53 
 
 
375 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  48.79 
 
 
373 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.06 
 
 
394 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  52.6 
 
 
392 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  49.73 
 
 
380 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  49.47 
 
 
380 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  51.27 
 
 
384 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  50.4 
 
 
380 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.73 
 
 
377 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  49.34 
 
 
380 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  48.92 
 
 
378 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.56 
 
 
412 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.53 
 
 
377 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.56 
 
 
412 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  48.92 
 
 
377 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.73 
 
 
377 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  48.92 
 
 
377 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  48.92 
 
 
378 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  49.06 
 
 
377 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  48.92 
 
 
377 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  49.6 
 
 
377 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  47.68 
 
 
381 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  50.27 
 
 
372 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.83 
 
 
394 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  49.14 
 
 
366 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  49.19 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.28 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.57 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 
394 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  48.01 
 
 
375 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  47.73 
 
 
375 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.63 
 
 
380 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.46 
 
 
396 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  47.54 
 
 
344 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  45.78 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  43.25 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  45.91 
 
 
389 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  37.75 
 
 
415 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  42.66 
 
 
370 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  37.22 
 
 
410 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  40.64 
 
 
455 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  39.26 
 
 
426 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  38.44 
 
 
451 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  39.7 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  39.6 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  38.44 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  38 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  38.85 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  39.1 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  37.12 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  36.43 
 
 
406 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  37.22 
 
 
413 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  37.82 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  38.38 
 
 
418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  39 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  37.73 
 
 
406 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.62 
 
 
404 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  38.89 
 
 
404 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
404 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  38.89 
 
 
404 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.7 
 
 
382 aa  259  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  37.73 
 
 
403 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  37.99 
 
 
403 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  37.99 
 
 
403 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  37.73 
 
 
403 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  37.73 
 
 
403 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  42.28 
 
 
312 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  37.47 
 
 
403 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  37.73 
 
 
468 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  37.04 
 
 
412 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  35.54 
 
 
414 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  40.26 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.82 
 
 
382 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.03 
 
 
382 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 
382 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.58 
 
 
387 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>