More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3852 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  872    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  56.29 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  50 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  38.74 
 
 		 433 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  38.74 
 
 		 433 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  38.65 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  40.1 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.56 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  38.65 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  39.46 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.61 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  36.22 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 458 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  40.3 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 445 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 437 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  32.95 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  35.23 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  37.97 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  39.04 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 458 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  36.46 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  39.44 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  32.3 
 
 		 452 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.02 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.81 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 443 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3237  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 456 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2054  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 454 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.12 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.03 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.03 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.79 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.79 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.79 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.79 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 447 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  31.73 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  32.47 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  30.55 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 487 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0646  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 617 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  30.58 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.97 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>