More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5564 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  92.13 
 
 		 513 aa  953    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  63.44 
 
 		 516 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  87.06 
 
 		 510 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  87.06 
 
 		 510 aa  910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  87.06 
 
 		 510 aa  910    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 510 aa  1026    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  62.58 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  49.34 
 
 		 527 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  46.94 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 464 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 485 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  33.66 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  36.45 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  34.83 
 
 		 497 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 486 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 490 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  35.2 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  27.04 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 487 aa  170  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 507 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 490 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 506 aa  88.6  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.55 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.65 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.75 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.55 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.7 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  25.28 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.81 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.37 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.93 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  25.63 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.15 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.21 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.33 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.42 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.7 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.7 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.24 
 
 		 480 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  24.45 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>