More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0605 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  1003    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  48.3 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 		 510 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 		 510 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  47.55 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  46.94 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  45.57 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  35.54 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 467 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  34.21 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  38.08 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  34 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  34.69 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 488 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  33.87 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  34.44 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 493 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  32.02 
 
 		 487 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  31.45 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  34.37 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 510 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  26.74 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 496 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  33.85 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 507 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 469 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 521 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 459 aa  99.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 477 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 482 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 501 aa  91.3  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 490 aa  90.5  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 487 aa  86.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.08 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  23.83 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.72 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 443 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  26.87 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.12 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  23.93 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  23.93 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  22.76 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  22.76 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.84 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.84 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.84 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.84 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  21.95 
 
 		 462 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 494 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>