More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2076 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.7 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  42.45 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.28 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.28 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.28 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36.75 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  38.71 
 
 		 473 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  38.95 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.32 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  37.39 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  32.06 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  32.82 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  32.74 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  37.19 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 236 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  38.75 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  38.75 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  44.19 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.77 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  38.75 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.78 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>