More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1779 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  735    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  73.22 
 
 		 377 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0359  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 428 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  29.32 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.32 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  29.64 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 433 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 453 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 449 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  27.61 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  27.61 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  27.61 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 433 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  27.25 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 433 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  26.3 
 
 		 440 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 434 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 434 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  29.38 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  28.49 
 
 		 468 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  28.72 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  28.49 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  28.49 
 
 		 468 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 431 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4460  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 486 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.63 
 
 		 431 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 435 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  25.91 
 
 		 435 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 431 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.83 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 431 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 434 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  26.12 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  26.33 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  26.74 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 424 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 423 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 428 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 427 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 430 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  26.53 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>