More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3043 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 611 aa  1243    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  54.02 
 
 		 619 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  38.45 
 
 		 741 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  38 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  37.52 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38.04 
 
 		 741 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.54 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 		 741 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  39.24 
 
 		 689 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.81 
 
 		 683 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.65 
 
 		 683 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  37.65 
 
 		 645 aa  342  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.82 
 
 		 734 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.82 
 
 		 731 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.75 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.75 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.75 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.75 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.75 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  33.12 
 
 		 618 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.82 
 
 		 731 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  40.66 
 
 		 796 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  35.3 
 
 		 777 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  39.26 
 
 		 841 aa  324  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  39.26 
 
 		 841 aa  324  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  37.19 
 
 		 757 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  39.45 
 
 		 838 aa  323  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  38.16 
 
 		 734 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  38.67 
 
 		 841 aa  323  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.78 
 
 		 734 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  38.48 
 
 		 785 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  37.59 
 
 		 788 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 		 774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  38.6 
 
 		 783 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  37.87 
 
 		 730 aa  307  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 767 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.63 
 
 		 661 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  33.63 
 
 		 661 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 661 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.97 
 
 		 778 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  36.81 
 
 		 907 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  37.41 
 
 		 771 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.81 
 
 		 748 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.72 
 
 		 616 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.08 
 
 		 767 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  36.81 
 
 		 756 aa  300  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  36.81 
 
 		 572 aa  299  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  37 
 
 		 755 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  36.6 
 
 		 794 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  34.04 
 
 		 780 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  36.12 
 
 		 792 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  36.61 
 
 		 769 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  32.68 
 
 		 645 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.45 
 
 		 618 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  32.94 
 
 		 922 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  32.24 
 
 		 712 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 916 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  32.94 
 
 		 874 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.56 
 
 		 735 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 		 775 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 		 775 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  33.02 
 
 		 921 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  35.9 
 
 		 775 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.55 
 
 		 668 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  32.9 
 
 		 687 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 775 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 775 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 775 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 775 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  34.79 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  31.06 
 
 		 641 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  34.4 
 
 		 668 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  31.83 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.63 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  31.77 
 
 		 706 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  31.77 
 
 		 706 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  31.77 
 
 		 706 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.98 
 
 		 668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  35.32 
 
 		 763 aa  275  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 763 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 763 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  31.38 
 
 		 700 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.52 
 
 		 692 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 763 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  32.11 
 
 		 716 aa  273  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 748 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 748 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 748 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 724 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.71 
 
 		 794 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  35.5 
 
 		 748 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  34.95 
 
 		 748 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 		 762 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 		 725 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 		 762 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>