More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4180 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
394 aa  813    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  43.22 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  40.7 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  40.45 
 
 
402 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  40.45 
 
 
402 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  39.95 
 
 
402 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  39.95 
 
 
402 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.4 
 
 
388 aa  206  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.76 
 
 
389 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.15 
 
 
384 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.04 
 
 
385 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.8 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.77 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.59 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.66 
 
 
390 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  32.45 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.05 
 
 
383 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  35.85 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.07 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  31.45 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 
388 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 
382 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.02 
 
 
389 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  36.66 
 
 
382 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.16 
 
 
388 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  33.68 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  33.62 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.21 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  30 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 
389 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 
390 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  34.05 
 
 
385 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 
388 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  34.59 
 
 
391 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30.41 
 
 
380 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.32 
 
 
378 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.07 
 
 
402 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.16 
 
 
403 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.07 
 
 
402 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
387 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.9 
 
 
389 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  30.16 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  32.76 
 
 
390 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.48 
 
 
390 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.61 
 
 
383 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.21 
 
 
393 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.66 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.12 
 
 
381 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  30.05 
 
 
381 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  31.93 
 
 
404 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  31.1 
 
 
394 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  29.82 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.48 
 
 
383 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  29.31 
 
 
379 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.11 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  29.37 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.05 
 
 
379 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  34.57 
 
 
372 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.31 
 
 
379 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.65 
 
 
406 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.73 
 
 
391 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.53 
 
 
387 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  31.07 
 
 
384 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  31.5 
 
 
404 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.63 
 
 
388 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  32.19 
 
 
378 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  31.44 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.26 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  31.19 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 
395 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.75 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  30.79 
 
 
389 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  31.5 
 
 
382 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  32.41 
 
 
388 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  32.41 
 
 
388 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  32.41 
 
 
388 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  29.44 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.13 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.89 
 
 
378 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  30.81 
 
 
390 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  30.38 
 
 
388 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  28.78 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.84 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.94 
 
 
385 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  28.93 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  30.77 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  28.83 
 
 
390 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.25 
 
 
392 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  32.48 
 
 
548 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  30.39 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  29.35 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  31.31 
 
 
405 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  28.16 
 
 
389 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  28.4 
 
 
402 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  31.23 
 
 
390 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>