More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2677 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 392 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  30.75 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  32.95 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  31.59 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.79 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  30.34 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  29.79 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  31.7 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  33.7 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 792 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  29.59 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  28.73 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.32 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  30.74 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.82 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  27.4 
 
 		 386 aa  100  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.75 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  27.36 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  33.62 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  26.16 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  24.62 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.53 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 1040 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.11 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.7 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.08 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.69 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  26.59 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  26.03 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  27.51 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.59 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.04 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.21 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25.08 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.46 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.56 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.28 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  25.57 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  24.05 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.74 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.15 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.31 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  23.99 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.23 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  22.34 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  28.08 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  25.37 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.05 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  27.33 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.65 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>