208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0779 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
747 aa  1537    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.93 
 
 
585 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.82 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.21 
 
 
583 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  29.24 
 
 
607 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  28.21 
 
 
550 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.39 
 
 
561 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  26.99 
 
 
545 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.98 
 
 
586 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.31 
 
 
556 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.38 
 
 
572 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.33 
 
 
554 aa  133  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.95 
 
 
554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.08 
 
 
596 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.08 
 
 
596 aa  130  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.08 
 
 
596 aa  130  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.11 
 
 
578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
561 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  27.39 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  26.3 
 
 
590 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.3 
 
 
541 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.94 
 
 
584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.69 
 
 
558 aa  114  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.67 
 
 
1391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  24.58 
 
 
568 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.58 
 
 
568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.96 
 
 
569 aa  111  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 
554 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.05 
 
 
1349 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.94 
 
 
548 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.47 
 
 
1570 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.14 
 
 
550 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.66 
 
 
692 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.47 
 
 
595 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 
592 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.15 
 
 
567 aa  104  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.95 
 
 
559 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.95 
 
 
551 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.6 
 
 
599 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.95 
 
 
559 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.83 
 
 
538 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.68 
 
 
538 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.95 
 
 
551 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.95 
 
 
551 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.95 
 
 
551 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.95 
 
 
551 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  24.54 
 
 
597 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.03 
 
 
588 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.7 
 
 
590 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 
558 aa  99.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.63 
 
 
569 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.12 
 
 
562 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25.12 
 
 
565 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.88 
 
 
562 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.2 
 
 
692 aa  97.8  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  23.6 
 
 
531 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.15 
 
 
567 aa  96.3  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  21.97 
 
 
555 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  25.29 
 
 
576 aa  96.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.65 
 
 
562 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.48 
 
 
575 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.73 
 
 
559 aa  95.1  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  25.1 
 
 
561 aa  94.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  24.94 
 
 
581 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.81 
 
 
561 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.81 
 
 
561 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.58 
 
 
546 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.38 
 
 
561 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  21.84 
 
 
547 aa  94  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.33 
 
 
573 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.22 
 
 
557 aa  92  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.88 
 
 
607 aa  92  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.71 
 
 
561 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 
571 aa  90.1  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  22.62 
 
 
531 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  21.21 
 
 
537 aa  89.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.88 
 
 
602 aa  90.1  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  23.28 
 
 
442 aa  89.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.4 
 
 
574 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.03 
 
 
549 aa  89  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.7 
 
 
585 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  24.51 
 
 
570 aa  88.2  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  22.05 
 
 
544 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.6 
 
 
554 aa  87.4  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  24.07 
 
 
574 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.16 
 
 
554 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23 
 
 
567 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23 
 
 
567 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.34 
 
 
567 aa  87  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.82 
 
 
565 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  25.1 
 
 
595 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  21.69 
 
 
544 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.06 
 
 
585 aa  87  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.23 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  23.03 
 
 
543 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.95 
 
 
568 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  25.21 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.46 
 
 
568 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.16 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.51 
 
 
548 aa  86.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>