More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0060 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  61.2 
 
 
543 aa  642  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  60.23 
 
 
555 aa  635  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  97.89 
 
 
542 aa  1011  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  62.55 
 
 
551 aa  636  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  97.8 
 
 
542 aa  1054  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  93.69 
 
 
543 aa  978  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  100 
 
 
545 aa  1080  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  61.73 
 
 
542 aa  642  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  78.24 
 
 
543 aa  834  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.81 
 
 
551 aa  643  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  62.93 
 
 
552 aa  637  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  63.04 
 
 
552 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  60.76 
 
 
553 aa  621  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  60.54 
 
 
551 aa  614  1e-174  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  58.45 
 
 
557 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  57.56 
 
 
558 aa  608  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  56.28 
 
 
543 aa  602  1e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  60.23 
 
 
539 aa  604  1e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  56.2 
 
 
559 aa  600  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  57.23 
 
 
563 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  58.63 
 
 
558 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  57.2 
 
 
547 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  54.17 
 
 
560 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  53.97 
 
 
570 aa  556  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  54.56 
 
 
553 aa  555  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  53.65 
 
 
552 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  55.07 
 
 
500 aa  549  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  51.89 
 
 
554 aa  542  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  50.86 
 
 
554 aa  537  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  50.96 
 
 
557 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  53.04 
 
 
561 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  51.17 
 
 
540 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  54.58 
 
 
541 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  51.36 
 
 
545 aa  526  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  50.1 
 
 
553 aa  522  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  52.43 
 
 
548 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.46 
 
 
527 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  48.92 
 
 
559 aa  509  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.19 
 
 
530 aa  505  1e-142  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  52.82 
 
 
554 aa  506  1e-142  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  51.93 
 
 
549 aa  508  1e-142  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  50 
 
 
548 aa  498  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  51.46 
 
 
550 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.39 
 
 
529 aa  494  1e-138  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.14 
 
 
555 aa  494  1e-138  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  49.7 
 
 
547 aa  493  1e-138  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.18 
 
 
532 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  49.62 
 
 
562 aa  491  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.23 
 
 
536 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  45.32 
 
 
558 aa  475  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  49.32 
 
 
560 aa  474  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  49.51 
 
 
558 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  49.71 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  5.03304e-07 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.05 
 
 
537 aa  472  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  49.32 
 
 
553 aa  466  1e-130  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  46.89 
 
 
528 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  2.04198e-07 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.92 
 
 
546 aa  435  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.5 
 
 
525 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.74 
 
 
519 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.62 
 
 
528 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.66 
 
 
525 aa  407  1e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  41.47 
 
 
535 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.48 
 
 
538 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.45 
 
 
550 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.97 
 
 
527 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.98 
 
 
536 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  40.19 
 
 
541 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.73 
 
 
553 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.73 
 
 
553 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  38.51 
 
 
548 aa  357  3e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  36.89 
 
 
559 aa  356  6e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.07 
 
 
542 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39.8 
 
 
535 aa  353  6e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 
567 aa  351  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.77 
 
 
548 aa  343  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.78 
 
 
570 aa  343  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.57 
 
 
529 aa  342  8e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  37.76 
 
 
527 aa  340  3e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.57 
 
 
536 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  37.02 
 
 
533 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36 
 
 
553 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.29 
 
 
551 aa  329  8e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.49 
 
 
542 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.5 
 
 
577 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  35.26 
 
 
560 aa  323  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.45 
 
 
558 aa  321  2e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.2 
 
 
568 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.15 
 
 
563 aa  315  1e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.96 
 
 
530 aa  306  8e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  36.04 
 
 
539 aa  296  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.31 
 
 
531 aa  290  5e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  32.29 
 
 
549 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.84 
 
 
552 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.2 
 
 
523 aa  273  4e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  31.02 
 
 
547 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.24 
 
 
527 aa  269  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.13 
 
 
558 aa  269  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.08 
 
 
541 aa  267  3e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  34.03 
 
 
534 aa  259  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  34.03 
 
 
534 aa  259  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>