More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13240 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.46 
 
 
922 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
978 aa  1875    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  47.67 
 
 
927 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.71 
 
 
899 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  44.55 
 
 
861 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
875 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  43.03 
 
 
915 aa  532  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.96 
 
 
922 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  32.92 
 
 
544 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  35.48 
 
 
556 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  34.37 
 
 
548 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  31.75 
 
 
546 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  34 
 
 
548 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  31.39 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
564 aa  215  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  30.13 
 
 
542 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  31.95 
 
 
564 aa  211  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  31.09 
 
 
545 aa  210  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  31.98 
 
 
564 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  33.57 
 
 
552 aa  205  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  28.32 
 
 
564 aa  199  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  32.4 
 
 
564 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  31.35 
 
 
555 aa  198  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  28.4 
 
 
598 aa  194  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  27.29 
 
 
614 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  28.27 
 
 
585 aa  188  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  26.8 
 
 
563 aa  188  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  29.51 
 
 
574 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  27.84 
 
 
613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  28.3 
 
 
608 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  27.95 
 
 
608 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  27.26 
 
 
573 aa  183  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  28.11 
 
 
571 aa  178  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  29.03 
 
 
608 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  27.47 
 
 
554 aa  176  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  28.75 
 
 
629 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  28.72 
 
 
624 aa  171  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  28.62 
 
 
624 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  27.77 
 
 
628 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 
525 aa  158  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  27.56 
 
 
581 aa  148  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
310 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 
294 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
293 aa  137  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
291 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 
308 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
320 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
290 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
339 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
339 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
302 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 
318 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
302 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
301 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
302 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
298 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
303 aa  127  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
302 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
294 aa  126  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  33.53 
 
 
296 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
296 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  34.08 
 
 
301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 
301 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 
300 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
300 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  32.73 
 
 
300 aa  114  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
299 aa  104  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.22 
 
 
314 aa  94.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
887 aa  92.8  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 
551 aa  91.3  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 
501 aa  90.9  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.1 
 
 
520 aa  88.2  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  23.43 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 
567 aa  85.9  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  26.54 
 
 
503 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  23.34 
 
 
520 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  22.09 
 
 
495 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  21.55 
 
 
553 aa  83.2  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  24.51 
 
 
552 aa  83.2  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  24.11 
 
 
588 aa  81.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3218  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 
495 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 
528 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  32.64 
 
 
304 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.99 
 
 
524 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  25.33 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  25.68 
 
 
632 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.9 
 
 
513 aa  79  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
522 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  24.84 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  24.15 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  24.84 
 
 
510 aa  77.4  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  23.61 
 
 
539 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>