More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1293 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  71.9 
 
 
519 aa  776    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  67.25 
 
 
517 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  63.65 
 
 
507 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  74.31 
 
 
511 aa  783    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  100 
 
 
510 aa  1041    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  74.6 
 
 
500 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  73.86 
 
 
506 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  67.05 
 
 
517 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  71.6 
 
 
536 aa  762    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  70.66 
 
 
539 aa  750    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  75.64 
 
 
506 aa  769    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  71.71 
 
 
519 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  68.58 
 
 
547 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  78.19 
 
 
530 aa  818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.55 
 
 
526 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  57.28 
 
 
511 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  57.34 
 
 
504 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  57.74 
 
 
504 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  56.89 
 
 
508 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  56.52 
 
 
503 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  56.75 
 
 
504 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  56.92 
 
 
503 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  55.95 
 
 
510 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  56.44 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  56.44 
 
 
510 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  55.75 
 
 
503 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  56.24 
 
 
510 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  56.19 
 
 
509 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  56.15 
 
 
512 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  54.65 
 
 
507 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  54.71 
 
 
504 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  54.55 
 
 
505 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  56.39 
 
 
504 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  54.35 
 
 
518 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  54.9 
 
 
506 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  54.79 
 
 
509 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  53.47 
 
 
507 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  54.69 
 
 
506 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  53.83 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  54.26 
 
 
501 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  54.47 
 
 
501 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  57.71 
 
 
503 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  51.44 
 
 
504 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  50.31 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  49.9 
 
 
485 aa  432  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 
502 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 
507 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 
504 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 
507 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
553 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
493 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
493 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.34 
 
 
514 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
498 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
520 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
525 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 
512 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
539 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
508 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
499 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  38.22 
 
 
510 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
557 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.4 
 
 
513 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
566 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 
513 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
510 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 
490 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
495 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
662 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
563 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.6 
 
 
514 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 
561 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 
510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
510 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
563 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  36.21 
 
 
533 aa  263  6.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.42 
 
 
561 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
563 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 
510 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 
510 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
563 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 
561 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.1 
 
 
561 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
582 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
518 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 
518 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 
582 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
499 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
569 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>