240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2414 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 410 aa  815    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.33 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  31.86 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  29.69 
 
 		 287 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  30.25 
 
 		 273 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  30.42 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  29.73 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  31.86 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  31.42 
 
 		 278 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  31.44 
 
 		 270 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  31.56 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  31.56 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  28.68 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 268 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  33.03 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  30.15 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  32.11 
 
 		 270 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 280 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  29 
 
 		 280 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  29 
 
 		 280 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  29 
 
 		 280 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  29 
 
 		 280 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  30 
 
 		 279 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  27.64 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  30 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  30 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.8 
 
 		 278 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  27.32 
 
 		 280 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  27.64 
 
 		 280 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 283 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 285 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  28.29 
 
 		 280 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  28.65 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  25.36 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.74 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  26.4 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  32.09 
 
 		 730 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  25.89 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  25.2 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  30.95 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  22.75 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.24 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.24 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  21.89 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.78 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.24 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.83 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  25.42 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.83 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.45 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  30.82 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.11 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.6 
 
 		 716 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 718 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.36 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.92 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  29.73 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>