More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1169 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  571  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  41.46 
 
 
296 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  40.77 
 
 
294 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  42.69 
 
 
287 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.01 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  34.73 
 
 
293 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  34.73 
 
 
293 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  34.73 
 
 
293 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  34.75 
 
 
295 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  34.78 
 
 
299 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.87 
 
 
299 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  36.59 
 
 
288 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.56 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  30.33 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  33.09 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
307 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  34.41 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  34.14 
 
 
311 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.77 
 
 
318 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.06 
 
 
331 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  36.24 
 
 
313 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.43 
 
 
309 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  33.7 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  36.33 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  34.71 
 
 
311 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  33.82 
 
 
284 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  29.35 
 
 
295 aa  118  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  32.97 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  31.41 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  33.45 
 
 
284 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  34.77 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.97 
 
 
292 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.39 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.96 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 
291 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  31.62 
 
 
300 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.66 
 
 
281 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  34.46 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.76 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  35.54 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.76 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.49 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  35.23 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 
312 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  29.25 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  30.59 
 
 
324 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  30.32 
 
 
297 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.78 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 
329 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
329 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  30.13 
 
 
307 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  33.82 
 
 
317 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.88 
 
 
285 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.77 
 
 
302 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.37 
 
 
292 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  35.46 
 
 
313 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
305 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  34.87 
 
 
302 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  33.2 
 
 
298 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  31.5 
 
 
292 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  26.64 
 
 
288 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  30.43 
 
 
293 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
288 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.32 
 
 
319 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.25 
 
 
288 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  32.03 
 
 
303 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  32.35 
 
 
303 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
297 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.95 
 
 
295 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.37 
 
 
295 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.37 
 
 
317 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
277 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  27.84 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.52 
 
 
301 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  29.83 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  28.92 
 
 
297 aa  99  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.03 
 
 
310 aa  99  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.67 
 
 
304 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.8 
 
 
338 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  26.87 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.42 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  29.67 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.49 
 
 
347 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29.89 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  26.55 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  33.57 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  30.07 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.69 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>